Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3EO15041 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3EO15041 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms