Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLGNO14967 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLGNO14967 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLGNO14967 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLGNO14967 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms