Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHLHE40O14503 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms