Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF5O00463 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms