Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP1O00294 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP1O00294 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TULP1O00294 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TULP1O00294 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP1O00294 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms