Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN25C9JDP6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms