Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37CA5D8V6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS37CA5D8V6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms