Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEFA5A3E0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEFA5A3E0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEFA5A3E0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POTEFA5A3E0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEFA5A3E0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms