Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
XIRP2A4UGR9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
XIRP2A4UGR9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms