Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms