Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC144AA2RUR9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC144AA2RUR9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC144AA2RUR9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms