Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRGMA1A4Y4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRGMA1A4Y4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms