Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms