Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 DZANK1-203ENST00000357236 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 DTNA-209ENST00000556414 1626 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RAB11A-209ENST00000569896 1396 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RBM5-AS1-201ENST00000630404 1386 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AKR1E2-203ENST00000345253 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 KIR2DL4-202ENST00000346587 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 TMEM244-201ENST00000368143 545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 SATB1-AS1-202ENST00000425799 611 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AL451081.2-201ENST00000448115 933 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AL603839.3-201ENST00000450713 605 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AL356310.1-201ENST00000452024 585 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC107029.1-201ENST00000484675 465 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RN7SL215P-201ENST00000487718 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC090539.2-201ENST00000523425 671 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC008991.1-201ENST00000591285 537 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RWDD1-204ENST00000487832 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 C1GALT1C1-202ENST00000371313 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 USP28-205ENST00000537706 1900 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TMEM225BP0DP42 IL37-202ENST00000311328 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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