Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.76■■■■□ 3
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms