Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIAS3Q9Y6X2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIAS3Q9Y6X2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms