Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA3Q9Y6H8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJA3Q9Y6H8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms