Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00312Q9Y6C7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms