Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP16Q9Y5T5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms