Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATF5Q9Y2D1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATF5Q9Y2D1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms