Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUDCQ9Y266 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUDCQ9Y266 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms