Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POMPQ9Y244 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POMPQ9Y244 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POMPQ9Y244 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POMPQ9Y244 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POMPQ9Y244 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POMPQ9Y244 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POMPQ9Y244 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms