Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNND2Q9UQB3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNND2Q9UQB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms