Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM35Q9UPQ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM35Q9UPQ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms