Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD1Q9UP38 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD1Q9UP38 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms