Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms