Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNPO2Q9UMS6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNPO2Q9UMS6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms