Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BARX2Q9UMQ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BARX2Q9UMQ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms