Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AMFRQ9UKV5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMFRQ9UKV5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms