Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP8AP2Q9UKL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP8AP2Q9UKL3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms