Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHIC2Q9UKJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CHIC2Q9UKJ5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms