Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC24A2Q9UI40 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC24A2Q9UI40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms