Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MLH3Q9UHC1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MLH3Q9UHC1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms