Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
KDM5BQ9UGL1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
KDM5BQ9UGL1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms