Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLIP2Q9UDT6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms