Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEF1Q9UBV8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEF1Q9UBV8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms