Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SPASTQ9UBP0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPASTQ9UBP0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms