Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNKQ9P0W0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms