Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SH3BP4Q9P0V3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SH3BP4Q9P0V3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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