Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms