Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMP5Q9NZZ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms