Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDK12Q9NYV4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK12Q9NYV4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms