Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MIS18AQ9NYP9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MIS18AQ9NYP9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms