Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DLL3Q9NYJ7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms