Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC10Q9NYD6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms