Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms