Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL2Q9NX52 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms