Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms