Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCC13Q9NSE7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCC13Q9NSE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms