Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOMER2Q9NSB8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms